Situata su uno sperone roccioso a picco sul mare tra Varigotti e capo noli, proprio sulle alture che circondano la baia del porto che fu interrato dai genovesi nel 1341, la chiesa medievale di San Lorenzo fu edificata presumibilmente su di un preesistente luogo di culto di età bizantina.

Nei primi decenni del XII secolo assunse l'attuale fisionomia ad opera dei monaci benedettini provenienti dall'isola di Lèrins a cui l'aveva affidata il vescovo di Albenga il 20 marzo 1127 dopo la distruzione di Rotari nel 693 d.c.

Lasciata in seguito dai monaci divenne la chiesa parrocchiale di Varigotti per 400 anni sino al 1586.

insieme al “castrum” di epoca bizantina costituisce un complesso di grande interesse storico e naturalistico.

L'edificio è a pianta rettangolare con abside pure rettangolare.

Sul lato a mare si aprono due porte a sesto acuto affiancate da finestre a feritoia, mentre sul lato a monte fu aggiunto un locale a pianta quadrata, successivamente ampliato con la costruzione di un vano attiguo con volta a crociera su costoloni tardo gotici.

Nel XVI secolo quando la sede parrocchiale fu trasferita nella nuova chiesa edificata lungo la spiaggia, San Lorenzo “vecchia” divenne cappella cimiteriale per poi essere successivamente abbandonata.

Gravemente danneggiata durante un bombardamento inglese nel 1944

venne restaurata una prima volta dal 1946 al 1950.

Definitivamente consolidata dal 1996 al 1998 con la ricostruzione del tetto a cura dell'Associazione “Amici di San Lorenzo”. Primo restauro in Liguria ad utilizzare l'elicottero per la movimentazione dei materiali.